Показательным примером имперского отношения к казачеству стала и русско-турецкая война 1828-1829 гг. Хотя она и велась за пределами Украины, однако ее материальные и человеческие ресурсы использовались шире. На острие борьбы двух империй оказалось последний очаг самобытной украинской политической организации – Задунайская Сечь.
В начале русско-турецкой войны 1500 казаков во главе с кошевым атаманом Задунайской Сечи Иосифом Гладким перешли на сторону русской армии под Измаилом, захватив с собой военную канцелярию и казну. Зажиточная верхушка казачества – «богачи» и «сребреники» – уже давно мечтала вернуться на Родину. Они надеялись воспользоваться обещанными царским правительством правами и привилегиями, получить имения, уложить в них свои сокровища и хозяйничать на широкую ногу. За ними пошло и несколько сотен старых казаков – бродяг и «голо-коленной бедноты». Они в первую очередь не желали, чтобы турецкие
власти использовать задунайское казачество для подавления национально – освободительной борьбы греков таких же, как и они, православных верующих. Так же казаки не желать участвовать в войне с вере русскими. Сформирован из задунайских казаков Дунайский полк в составе русской армии наиболее отличившихся при получении крепости Исакча.
Казаков, оставшихся в Задунайской Сечи, турки вырезали, укрепления разрушили, а сечевую церковь сожгли. Те, кому удалось спастись, поселились в разных городах и селах Добруджи. Почти 2 тыс. задунайцев, вместе с наказным кошевым атаманом И. Бадан, которые действовали далеко от Сечи, арестовали и бросили в стамбульской тюрьме. Впоследствии их освободили и разрешили снова поселиться в дельте Дуная, но о восстановлении Задунайской Сечи уже даже не упоминалось.
Трудно однозначно оценить итоги русско-турецкой войны 1828-1829 гг. для Украины. В целом она характеризовалась традиционным привлечением украинских ресурсов для решения задач Российской империи. Вместе с тем очередное столкновение двух империй перемололо на своих жерновах еще одно живое зерно когда-то полного колоса Войска Запорожского. С другой стороны, военные победы Российской империи уменьшили опасность турецкого вторжения на украинские земли, создали украинским благоприятные условия для освоения Северного Причерноморья.