Для региона характерно значительное расчленение рельефа. Па севере расположены высокие горные массивы, которые постепенно снижаются к югу. На юге Индокитая в дельтах крупных рек и в межгорных впадинах расположены низменности с плодородными почвами. Недра региона богаты некоторые виды полезных ископаемых. На шельфе Индонезии, Малайзии, Брунея и Вьетнама добывают нефть и газ. Через регион (Индонезия, Малайзия, Таиланд) тянется самый большой в мире оловянный пояс. Здесь имеются огромные запасы меди, вольфрама, цинка, свинца, никеля, золота, кобальта. Нерудные полезные ископаемые представлены калийной солью и драгоценными камнями.
Юго-Восточная Азия расположена в двух климатических поясах: экваториальном (Малайский архипелаг) и субэкваториальном (материковая часть). Самый теплый месяц на всей территории региона – апрель (+30 ° С). Особенно здесь ощутимо влияние муссонов, обусловливающих изменение сухого и дождливого сезонов. Филиппинские острова очень страдают из-за тропические ураганы тайфуны.
Большинство крупных рек (Меконг, Салуин, Иравади и др.). Начинаются высоко в горах. Густая речная сеть имеет дождевое питание, поэтому при муссонных ливней реки переполняются водой, а в сухое время года они мелеют, а иногда и вовсе пересыхают. Озер здесь очень мало.
Страны исключительно богатые лесные ресурсы. Леса покрывают более 12% территории региона. Местные породы деревьев (тик, сосны, сандаловое и мангровые деревья, пальмы) имеют очень ценные свойства (водоотталкивающую, прочность, огнестойкость, красивый цвет).